Eine FMS-DB hat immer 2 Nav Datensätze. Im Flug also den inaktiven Datensatz aktualisieren und nach der Landung einfach nur Umschalten zu können und somit Zeit am Boden zu minimieren halte ich für keine schlechte Idee. Aber klar, oberflächlich betrachtet klingt "Software im Flug updaten" nach einer eher suizidären Aktion. Dass man sowas nicht unbedingt braucht ist wieder eine andere Sache.

Die Avionics Firmware selbst könnte ebenfalls mit Fallbacks arbeiten, da würde das selbe passieren wie oben. Unterwegs ein Update einspielen aber nicht aktiv schalten und dann am Boden sozusagen den Flieger rebooten. Wen juckts, man sollte nur den Platz für einen dritten Datensatz haben, damit man ein kaputtes Update notfalls gegen was funktionierendes tauschen kann und nicht am Ende der Welt gestrandet ist weil sich ein Programmierer vertan hat.

Die Burschen bei Boeing bauen jetzt schon recht lange Flugzeuge, ich denke einen derartig dillettantischen Fehler werden sie sich nicht leisten. Es gab natürlich schon einige Unfälle mit den Fliegern des Herstellers, aber nur äusserst selten sind sie direkt und ausschliesslich dem Hersteller anzulasten.

Hm, der kritische Teil wird wohl sein, wenn die Boardsysteme aufgrund des Updates neu gestartet werden

Also meines Wissens werden Nav-DBs von der Maintenance mit Disketten, Speicherkarten oder USB-Sticks aktualisiert. Ich denke auch die 787 wird das so machen, selbst wenn man das im Flug machen könnte.
Somit ist das einhacken in die Verbindung keine realistische Gefahr. Aber wenn man Datenlinks der Flieger als generell unsicher erachtet, dann müsste schon lang höchste Gefahr im Verzug sein, weil einer Crew über ACARS gefährliche Falschinformationen zuspielen wäre wohl nur eines der Dinge die man tun könnte. Aber da diese Netzwerke grösstenteils nicht direkt ans Internet angeschlossen sind (und in sich drinnen auch nicht mal TCP/IP verwenden), ist diese Möglichkeit praktisch ausgeschlossen. Somit ruhig weiterschlafen. Wäre es technisch machbar, wäre es in Zeiten des Terrors ziemlich sicher schon gemacht worden. Ist es aber zum Glück nicht.